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病原微生物检测方案
病原微生物检测方案
宏基因组学(Metagenomics)，也称元基因组学，即“绕过对微生物个体进行分离培养，应用基因组学研究策略对自然环境/临床样本中的微生物遗传组成和群落功能进行研究”的学科。 宏基因组二代测序技术（metagenomics next-generation sequencing, mNGS）是借助二代测序平台快速测序获得样品中的核酸序列，并进一步与各个物种的基因组序列对比，从而得知样品中微生物的种类和比例的技术，因此近年来在临床微生物检测中得到了广泛应用。 除了宏基因组检测外，液滴数字PCR (Droplet digital PCR, ddPCR) 也被用于测定病原微生物的相对丰度和/或绝对丰度，基于微流体技术，将扩增反应分离为>20 000个个体的液滴，允许同时对多达4个目标生物或基因的DNA进行绝对定量，检测限为10^(-5)相对丰度。
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病原微生物检测方案
病原微生物检测方案
样本破碎研磨
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样本破碎研磨
由于宏基因组测序样本中往往是多种菌体混合在一起，很多样本较难破壁，例如呼吸道样本中的结合分歧杆菌、隐球菌等。使用生物样本均质仪配合不同的研磨介质，可有效保证难破壁病原体的检出，并且通过程序优化可兼顾易破壁病原体核酸的完整性。
仪器特点
6*2mL/24*2mL 无需处理直接破碎 杜绝交叉污染
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核酸提取
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核酸提取
当病原微生物检测方法为扩增子测序技术或杂交测序技术时，样品往往需要经过PCR扩增、文库构建等过程后才可用于后续检测，初始样本浓度需求量并没有很高，Auto-Pure 32A/96全自动核酸提取仪1ml的反应体系即可满足需求。开放式的软件设计，可适配市面各类提取试剂盒。用户根据反应体系、单次最大样本量等实际需求，选择合适的型号用于提取即可。
仪器特点
1ml反应体系 样本通量32/96 开放式设计
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文库构建
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文库构建
NGS 100R基因测序文库制备仪9工作板位+2废弃板位设计可一次性满足24个样本文库同时构建。仪器内置磁力架、PCR扩增仪等功能模块，基于核酸样品直接上样，可实现全自动文库构建中的片段化、末端修复、接头连接、PCR扩增、文库混合等过程，实现建库流程自动化。
仪器特点
内置PCR扩增仪 24个文库同时构建 1-200ul 8通道移液器
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样本浓度检测
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样本浓度检测
建库前后往往都需要对样本浓度进行精确定量，由于检测原理及检测下限的限制，微量分光光度计往往无法满足此类样本的检测需求。荧光计配合相应的检测染料，可特异性的对检测物质进行浓度测定，其中Fluo-200最低检测浓度0.1pg/ul（dsDNA），Fluo-800最低检测浓度1pg/ul（dsDNA）。 除了荧光计，荧光酶标仪同样可用于低浓度样本的检测，但是最大样本数量可达96，尤其适合样本数量较大的客户使用，减少操作时间。
仪器特点
Fluo系列荧光计： 1-20ul上样、最大1/8样本通量、最低检测浓度0.1pg/ul Feyond F100荧光酶标仪： 1-20ul上样、最大96样本通量、最低检测浓度0.5pg/ul
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